Cancer: ces 4 gènes aident à prédire l'issue
Des recherches approfondies sur le rôle du suppresseur de tumeur p53 offrent une meilleure compréhension des mutations génétiques qui sont en jeu dans diverses formes de cancer, ainsi que l'identification de quatre gènes qui peuvent aider à prédire les perspectives d'une personne.
Le TP53 gène est responsable du codage de ce que les scientifiques appellent la protéine tumorale p53 - un suppresseur de tumeur qui peut empêcher les cellules de se diviser et de proliférer trop rapidement.
Les chercheurs ont doublé TP53 le «gardien du génome» en raison de son rôle crucial dans la prévention des tumeurs et la maîtrise de la division cellulaire.
Les cancers humains présentent fréquemment des mutations dans le TP53 gène, provoquant l’échec de l’un des mécanismes défensifs critiques contre le cancer.
Les premières études qui ont identifié TP53 des mutations dans les cancers humains sont apparues dans les années 1980 et, depuis lors, les chercheurs ont consacré beaucoup de temps et de ressources à clarifier son rôle dans le cancer.
Aujourd'hui, la plus grande étude du genre utilise des échantillons de tumeurs provenant de plus de 10000 patients atteints de cancer et examine 32 types de cancer différents pour mieux comprendre le rôle de TP53.
Le Dr Larry Donehower, professeur de virologie moléculaire et de microbiologie au Baylor College of Medicine à Houston, TX, a dirigé la nouvelle recherche, qui apparaît dans la revue Rapports de cellule.
Les gènes Telltale 4 peuvent aider à prédire les perspectives
Le Dr Donehower et son équipe ont utilisé cinq plates-formes de données différentes pour extraire 10 225 échantillons de 32 cancers. À l'aide de l'Atlas du génome du cancer (TCGA), les chercheurs ont pu évaluer de manière exhaustive le rôle de la voie p53 dans ces 32 cancers.
Le Dr Donehower et ses collègues ont ensuite comparé les données du TCGA avec une autre base de données de 80 000 mutations génétiques que le Dr Thierry Soussi - professeur de biologie moléculaire à l'Université de la Sorbonne à Paris, France - avait rassemblé sur une période de 30 ans.
Les chercheurs ont constaté que TP53 les mutations se produisaient plus souvent chez les personnes qui avaient de moins bonnes perspectives. En outre, l'analyse a révélé que «Plus de 91% des cancers avec TP53 les mutations montrent une perte des deux TP53 allèles »ou variantes de gènes.
Le Dr Donehower explique: «Dans certains gènes du cancer, vous verrez une copie des deux gènes perdue ou mutée», mais «plus de 91% de tous les cancers perdent les deux TP53 des gènes, pas seulement un.
La deuxième perte d'allèle, écrivent les auteurs, s'est produite par «mutation, délétion chromosomique ou perte d'hétérozygotie sans copie» - c'est-à-dire la duplication de gène. Le chercheur principal note également que ce dernier processus s'est produit beaucoup plus fréquemment qu'ils ne le pensaient auparavant.
Surtout, la recherche a également identifié quatre gènes qui montraient une surexpression chez le mutant TP53 tumeurs. Selon les chercheurs, ces quatre gènes peuvent «dire» si un patient atteint de cancer a de bonnes perspectives ou non.
«Si vous avez une expression élevée de ces quatre gènes, vous avez un patient qui est plus susceptible d'avoir un mauvais pronostic […] Inversement, si ce patient a une très faible expression de ces gènes, il va probablement survivre plus longtemps et avoir un bon pronostic.
Dr Larry Donehower
"Cela vous donnera une meilleure idée de la façon dont il s'en sortira que de simplement savoir s'il est mutant pour TP53 ou pas », poursuit le Dr Donehower.
Enfin, l'étude a fortement associé TP53 mutations avec instabilité génomique, une constatation conforme à TP53Le rôle typique de «gardien du génome».
Le Dr Donehower commente le caractère unique de la nouvelle recherche en disant: «La plupart des études sur TP53 se concentrer sur un type de cancer. »
«En examinant 32 types de cancer différents, vous constatez que certains schémas se maintiennent quel que soit le type de cancer.»
Le co-auteur de l'étude et directeur de la génomique du cancer au Baylor College of Medicine, le Dr David Wheeler, commente également l'importance des résultats.
Il dit: «Depuis TP53 est l'un des gardiens les plus importants de la prévention du cancer, mieux nous comprendrons ce gène, mieux nous serons en mesure de comprendre la biologie de base du cancer. Cela mènera à de meilleures thérapies.
