Probiotiques: les preuves correspondent-elles au battage médiatique?

Deux nouvelles études portant sur les probiotiques concluent qu'ils ne profitent pas à toutes les personnes; en fait, ils peuvent même avoir des conséquences négatives dans certains cas.

Les preuves correspondent-elles au battage médiatique?

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Les probiotiques sont disponibles dans de nombreux produits, du yogourt aux cornichons.

Les organismes vivants contenus dans la promesse de promouvoir un tractus gastro-intestinal sain.

Annoncés comme sûrs et naturels, les probiotiques ont pris d'assaut le marché. Ils prétendent stimuler notre flore intestinale et améliorer notre bien-être, le tout dans une délicieuse bouchée.

Cependant, comme le démontrent les dernières recherches, en biologie humaine, les choses sont rarement aussi simples.

À ce jour, les preuves pour étayer de nombreuses allégations de santé associées aux probiotiques font défaut. Pour cette raison, des chercheurs de l'Institut Weizmann et du Centre médical de Tel Aviv, tous deux en Israël, ont conçu deux des enquêtes les plus complètes à ce jour sur les probiotiques. Leurs résultats sont maintenant publiés dans la revue Cellule.

L'auteur principal Eran Elinav explique pourquoi l'équipe était intéressée à aborder ce sujet en disant: «Les gens ont beaucoup soutenu les probiotiques, même si la littérature qui sous-tend notre compréhension de ces derniers est très controversée.»

«Nous voulions déterminer», poursuit-il, «si les probiotiques, comme ceux que vous achetez au supermarché, colonisent le tractus gastro-intestinal comme ils le devraient, puis si ces probiotiques ont un impact sur le hôte humain. »

Une nouvelle approche

La plupart des études antérieures portant sur les probiotiques ont évalué les espèces de bactéries présentes dans les intestins des participants en analysant des échantillons de selles, mais ce type de mesure indirecte n’est pas idéal.

Pour améliorer cette méthode, dans la première étude des scientifiques, ils ont mesuré directement les bactéries intestinales, à l’aide d’endoscopies et de coloscopies. En tout, 25 personnes ont été échantillonnées, mais seulement 15 sont passées à l'étape suivante.

L'équipe les a divisés en deux groupes: l'un a pris des probiotiques génériques, tandis que l'autre a pris un placebo. Peu de temps après, leurs bactéries intestinales ont été évaluées à nouveau, puis, finalement, elles ont été analysées une troisième fois, 2 mois après l'intervention.

Ils ont constaté que certaines personnes avaient simplement expulsé les probiotiques; l'équipe les a qualifiés de résistants. Inversement, les tripes de certaines personnes ont accueilli les nouveaux microbes et ont réussi à coloniser leur intestin; on les appelait persister.

Les chercheurs ont également révélé qu'en analysant l'expression originale du microbiome et des gènes intestinaux d'un individu, ils pouvaient prédire correctement qui serait un persistant et qui serait un résistant.

Ensuite, ils ont comparé l'analyse des selles à l'échantillonnage direct et ont constaté qu'il n'y avait qu'une corrélation partielle. Il semble que les échantillons de selles ne soient pas nécessairement un indicateur fiable pour évaluer la flore intestinale.

«Bien que tous nos volontaires consommateurs de probiotiques aient montré des probiotiques dans leurs selles», explique le co-auteur de l'étude Eran Segal, biologiste informatique, «seuls certains d'entre eux les ont montrés dans leur intestin, c'est là qu'ils doivent être.»

«Si certaines personnes résistent et que seules certaines personnes le permettent», poursuit-il, «les avantages des probiotiques standard que nous prenons tous ne peuvent pas être aussi universels que nous le pensions autrefois. Ces résultats mettent en évidence le rôle du microbiome intestinal dans la conduite de différences cliniques très spécifiques entre les personnes.

Récupération des probiotiques et des antibiotiques

Dans la seconde étude, l'équipe a tenté de répondre à une question différente. Après une cure d’antibiotiques, qui élimine le microbiome d’un individu, il est souvent conseillé aux patients de prendre des probiotiques. Les chercheurs voulaient savoir s'il s'agissait vraiment d'un bon plan d'action.

Pour enquêter, 21 participants ont suivi une cure d'antibiotiques avant d'être divisés en trois groupes:

• un groupe témoin dans lequel les microbiomes des membres ont été laissés à récupérer sans aucune intervention
• un groupe dans lequel les membres ont pris les mêmes probiotiques que ceux utilisés dans la première expérience
• un groupe dans lequel les membres ont réintégré leurs microbiomes d'origine

Les chercheurs ont atteint cet objectif en traitant ces participants avec une greffe de microbiome fécal autologue (aFMT) basée sur leurs propres bactéries collectées avant de prendre des antibiotiques.

Ceux qui ont pris les probiotiques standard ont vu une recolonisation rapide. Cependant, la prise de contrôle rapide des probiotiques a empêché les bactéries normales des participants de se repeupler, et la flore intestinale n'est pas revenue à la normale pendant des mois après.

Le groupe aFMT, quant à lui, a vu un retour à la normale en quelques jours seulement.

«Contrairement au dogme actuel selon lequel les probiotiques sont inoffensifs et profitent à tout le monde, ces résultats révèlent un nouvel effet secondaire potentiel de l'utilisation des probiotiques avec des antibiotiques qui pourrait même avoir des conséquences à long terme.»

Eran Elinav

Comme l’ajoute Elinav, «En revanche, reconstituer l’intestin avec ses propres microbes est un traitement personnalisé conçu par mère nature qui a conduit à un renversement complet des effets des antibiotiques.»

À certains égards, les résultats ne sont pas surprenants; le microbiome est un réseau d'interactions très complexe, très variable entre les individus. Penser que nous pourrions le modifier avec succès et de manière bénéfique avec une intervention aussi simple était peut-être tiré par les cheveux.

Comme le dit Elinav, leurs résultats suggèrent que «les probiotiques ne devraient pas être universellement administrés comme un supplément« unique ». Au lieu de cela, ils pourraient être adaptés aux besoins de chaque individu. »