Prévenir les infections herpétiques: une étude offre de nouvelles perspectives
Une nouvelle recherche identifie un facteur clé qui détermine la progression du virus de l'herpès et montre que le cibler peut ralentir la progression virale.
Selon les dernières statistiques des Centers for Disease Control and Prevention (CDC), en 2015-2016, près de 48% des personnes aux États-Unis vivaient avec l'herpès simplex 1, une souche virale qui cause des infections buccales.
Dans le monde, 80% de la population est infectée par le virus. Une fois qu'une personne le contracte, le virus ne disparaît jamais - il reste en sommeil dans son corps tout au long de sa vie.
Bien que les symptômes de l'herpès passent parfois inaperçus, pour certaines personnes, ils peuvent être désagréables et douloureux.
Le virus de l'herpès est également très contagieux, car une personne peut le transmettre même si elle ne présente aucun symptôme.
De nouvelles recherches suggèrent que la contraction du virus pourrait bientôt être évitée, car les scientifiques offrent de nouvelles informations sur ce qui se passe au niveau cellulaire pendant une infection herpétique et trouvent un moyen de ralentir la progression de l'infection.
Emanuel Wyler, Ph.D., et Vedran Franke, Ph.D., de l'Institut de Berlin pour la biologie des systèmes médicaux, en Allemagne, sont les co-auteurs principaux du nouvel article, qui paraît dans la revue Communications de la nature.
Importance du facteur de transcription NRF2
Les scientifiques ont développé un algorithme qui leur a permis de prédire la progression d'une infection dans des cellules individuelles.
Les chercheurs ont utilisé le séquençage d'ARN unicellulaire pour analyser 12 000 cellules de peau humaine infectées par le virus de l'herpès simplex 1 (HSV1). Le séquençage d'ARN monocellulaire est une technique révolutionnaire qui permet de décomposer les expressions génétiques à un niveau beaucoup plus granulaire que le séquençage d'ARN en masse.
Les chercheurs expliquent la différence entre le séquençage d'ARN à cellule unique et le séquençage d'ARN en masse conventionnel en utilisant une analogie d'un smoothie.
«Si je mets dix types de fruits dans un mélangeur, je peux à peu près dire que le smoothie contient, par exemple, des mûres lorsque je le goûte», explique Wyler. «Avec le séquençage d'ARN unicellulaire, nous ne faisons pas un smoothie, nous faisons une salade de fruits. Je peux immédiatement identifier les mûres et dire exactement combien il y en a dans la salade.
La technique, combinée à l'algorithme, a révélé aux chercheurs qu'un facteur de transcription appelé NRF2 joue un rôle clé, son activation inhibant la progression de l'infection.
Les facteurs de transcription sont des protéines qui «décodent» les informations de notre génome et activent ou désactivent des gènes spécifiques en se liant à certaines régions d'ADN.
Franke explique comment la nouvelle technique a révélé l'importance du facteur de transcription NRF2.
«J'ai visualisé les changements dans la régulation de chaque gène que nous avons étudié dans une seule cellule», dit-il. "Cela nous a montré que le niveau d'activation du facteur de transcription NRF2 peut être un marqueur de résistance temporaire à l'infection HSV1."
Les chercheurs ont également découvert que deux agonistes ou activateurs de NRF2, appelés bardoxolone-méthyle et sulforaphane, altèrent la production du virus, c'est-à-dire qu'ils font activer moins de ses propres gènes. Cela a confirmé aux chercheurs le rôle clé de NRF2.
La bardoxolone-méthyle est un médicament conçu pour traiter une infection rénale chronique. Il en est actuellement à sa troisième phase d'essais cliniques.
Enfin, l'étude a également révélé que le stade du cycle cellulaire influence également la vulnérabilité d'une cellule à l'infection HSV1.
Les chercheurs expliquent que le virus de l'herpès est un bon «plan général» pour enquêter sur les états cellulaires dans les infections virales, et ils prévoient d'utiliser le séquençage d'ARN unicellulaire pour étudier les futurs virus.
