Le microbiote intestinal peut `` prévenir et guérir '' le rotavirus

Une découverte accidentelle chez la souris peut conduire à un remède contre l’une des infections les plus mortelles au monde.

Les chercheurs ont identifié une espèce bactérienne dans le microbiote intestinal qui protège contre le rotavirus hautement contagieux (photo).

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) estime que chaque année, 215 000 enfants de moins de 5 ans dans le monde meurent de déshydratation due à une diarrhée sévère.

Une infection à rotavirus incurable est responsable de ces cas.

Désormais, des chercheurs de l'Institute for Biomedical Sciences de la Georgia State University (GSU) à Atlanta ont identifié des microbiotes intestinaux spécifiques, ou micro-organismes, qui peuvent prévenir et guérir les infections à rotavirus.

Les résultats de leur étude apparaissent dans la revue Cellule.

«Cette étude», explique l'auteur principal Andrew Gewirtz, «montre qu'un grand déterminant de la propension à l'infection à rotavirus est la composition du microbiote.»

Qu'est-ce que le rotavirus?

Le rotavirus tire son nom de «rota» - le mot latin pour «roue» - car le virus a une forme ronde. Elle affecte le plus souvent les nourrissons et les jeunes enfants et se propage facilement. Les personnes atteintes du virus peuvent le transmettre en éternuant et en toussant ou en utilisant des mains non lavées ou mal lavées pour toucher, et ainsi contaminer, les surfaces et les objets.

Le virus peut se transmettre d'une personne à l'autre via des surfaces telles que des comptoirs et des éviers, ainsi que sur des jouets, des outils et des ustensiles partagés.

Les vaccins préviennent l'infection dans la plupart des cas et réduisent le risque d'infection grave. Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) estiment que le vaccin antirotavirus prévient chaque année 40 000 à 50 000 hospitalisations aux États-Unis.

Selon le CDC, les symptômes de l'infection comprennent «une diarrhée aqueuse sévère, des vomissements, de la fièvre ou des douleurs abdominales», avec une diarrhée et des vomissements qui durent généralement de 3 à 8 jours.

Dans les zones disposant d'un approvisionnement suffisant en eau propre, l'administration de liquides évite une déshydratation potentiellement mortelle.

Malheureusement, ce n'est pas le cas partout et l'infection à rotavirus est particulièrement mortelle dans certaines régions du monde à faible revenu.

Les infections à rotavirus peuvent être légères ou graves, et les raisons en sont restées inconnues jusqu'à la découverte par les chercheurs du GSU.

Une percée accidentelle

Comme l'expliquent les auteurs dans leur article, «la clairance [du rotavirus] nécessite généralement une immunité adaptative», mais dans ce cas, les scientifiques ont «involontairement» créé un modèle de souris immunodéficientes qui étaient également résistantes au virus.

Ainsi, les scientifiques ont émis l'hypothèse que cela pourrait être dû à «certains microbes» qui offraient une protection contre le virus. Pour vérifier leur hypothèse, ils ont testé si la «résistance au virus était transférée par cohabitation et transplantation fécale».

«Cette découverte était fortuite. Nous élevions des souris et nous nous sommes rendu compte que certains d'entre eux étaient complètement résistants au rotavirus, tandis que d'autres étaient très sensibles. Nous avons étudié pourquoi et constaté que les souris résistantes portaient un microbiote distinct. La greffe de microbiote fécal a transféré la résistance au rotavirus à de nouveaux hôtes. »

Andrew Gewirtz

Les chercheurs ont finalement découvert qu’une seule espèce bactérienne appelée bactéries filamenteuses segmentées (SFB) était le principal facteur déterminant la résistance d’un individu à l’infection à rotavirus.

Le SFB réduit également les dommages causés par le rotavirus en initiant à la fois l'excrétion des cellules épithéliales infectées et leur remplacement par de nouvelles cellules saines.

«C'est une nouvelle découverte de base qui devrait aider à comprendre la propension à l'infection à rotavirus», note Gewirtz.

La découverte par l'équipe du GSU n'est qu'un premier pas vers la lutte contre le rotavirus chez l'homme.

Le premier auteur Zhenda Shi, qui travaille à la branche rotavirus du CDC, examine actuellement la pertinence de cette découverte chez la souris pour les humains.

Comme le souligne Gewirtz, la recherche de l’équipe «ne donne pas de traitement immédiat pour les humains, mais fournit un mécanisme potentiel pour expliquer la sensibilité différentielle de différentes populations et de différentes personnes à l’infection virale entérique».

«De plus, cela peut conduire à de nouvelles stratégies de prévention et de traitement des infections virales», conclut-il.

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