Les bactéries intestinales peuvent aider à expliquer pourquoi les médicaments ne fonctionnent pas pour tout le monde

Certains médicaments fonctionnent bien pour une personne mais sont inefficaces pour une autre; certains produisent également des événements indésirables pour certains individus mais pas pour d'autres. Une étude, utilisant des bactéries intestinales humaines et un modèle de souris, examine si nos bactéries intestinales pourraient aider à expliquer pourquoi.

Les microbes présents dans nos intestins influencent-ils l'efficacité d'un médicament?

Depuis de nombreuses années, les scientifiques savent que les bactéries présentes dans nos intestins jouent un rôle essentiel dans la digestion.

À mesure que la technologie a progressé, il est devenu plus rapide et plus facile de caractériser notre microbiome et d'examiner de plus près son rôle dans la santé et la maladie.

Cependant, à mesure que de plus en plus d'informations se révèlent, la relation complexe entre les humains et nos microbes résidents devient de plus en plus alambiquée.

Les scientifiques étudient actuellement le rôle des bactéries intestinales dans un large éventail de maladies, de la maladie de Parkinson à l'anxiété en passant par les maladies cardiaques.

Autrefois une niche obscure de la recherche médicale, les bactéries intestinales sont désormais fermement à l'honneur.

Maintenant, une autre étude a examiné le rôle potentiel que nos bactéries intestinales pourraient jouer dans le métabolisme des médicaments. Après tout, lorsque nous prenons de la drogue par voie orale, beaucoup sont destinés à se retrouver dans notre intestin.

Les médicaments et nos microbes intestinaux

Parce que le microbiome diffère d'un individu à l'autre, cela soulève la question de savoir comment ces variations pourraient avoir un impact sur la façon dont nous métabolisons ces médicaments et comment ils pénètrent dans l'organisme.

Il est bien connu que les drogues n'affectent pas tout le monde de la même manière. Chez certaines personnes, un médicament peut bien fonctionner; pour d'autres, cela peut prendre plus de temps pour entrer en vigueur ou ne pas fonctionner du tout; chez certaines personnes, un médicament particulier peut produire des effets secondaires dangereux.

Il existe de nombreuses raisons pour lesquelles les gens réagissent différemment au même médicament, notamment l'âge, le sexe, la génétique et le régime alimentaire. Alors, les bactéries présentes dans notre intestin pourraient-elles également jouer un rôle?

Selon la dernière équipe de chercheurs à se pencher sur cette question, notre microbiome contient 150 fois plus de gènes que notre propre génome. Ces locataires microscopiques produisent une large gamme d'enzymes, dont certaines peuvent altérer les médicaments, soit les activer, soit les rendre inefficaces.

Les chercheurs ont entrepris de découvrir plus en détail l’influence du microbiome sur les médicaments. Dirigés par Andrew Goodman de la faculté de médecine de l'Université Yale à New Haven, CT, ils ont récemment publié leurs résultats dans la revue La nature.

Le groupe explique que des études antérieures ont montré comment les microbes peuvent influencer le fonctionnement de certains médicaments. Par exemple, la sulfasalazine, un médicament utilisé pour traiter la colite ulcéreuse, dépend des bactéries intestinales pour l'activer.

Inversement, Eggerthella lenta, une bactérie trouvée dans le côlon, peut inactiver le médicament cardiaque, la digoxine.

Cependant, bien que les scientifiques aient décrit l’impact du microbiome sur des médicaments spécifiques, Goodman et ses collègues expliquent que «les mécanismes moléculaires restent largement inconnus».

En outre, la communauté scientifique n'a pas encore décrit l'ampleur et la portée exactes de ce problème.

Enquêter sur leurs produits géniques et plus

Dans la dernière étude, les auteurs ont examiné les interactions entre les microbes et les médicaments en évaluant comment les bactéries intestinales humaines métabolisent une gamme de médicaments. Ils ont également cherché à identifier les produits géniques microbiens - principalement des enzymes - susceptibles de métaboliser les médicaments.

Au total, ils ont évalué les capacités de 76 souches courantes de bactéries intestinales à modifier 271 médicaments. Les médicaments ont été sélectionnés pour couvrir une grande variété de types, de mécanismes d'action et de propriétés chimiques.

Pour étudier davantage l'interaction, les scientifiques ont utilisé des souris gnotobiotiques - des animaux exempts de microbes.

Ils ont constaté que 176 des 271 médicaments (64,9%) pouvaient être métabolisés par des bactéries intestinales, ce qui réduisait considérablement la concentration du médicament. Ils ont également montré que chaque souche de bactérie pouvait métaboliser 11 à 95 types de médicaments.

Ils ont découvert qu'en utilisant des données métagénomiques - la somme des gènes d'une population de bactéries donnée - ils pouvaient expliquer le potentiel du groupe ou des espèces bactériennes individuelles à modifier les médicaments.

Les scientifiques espèrent qu'à l'avenir, cette compréhension pourrait aider les médecins à prédire comment les individus sont susceptibles de réagir aux médicaments. Les auteurs écrivent:

«Cela pourrait fournir un moyen de relier mécaniquement les informations sur le microbiome à la variation interpersonnelle du métabolisme et de la toxicité des médicaments.»

À l’avenir, il pourrait être possible de modifier le microbiome d’une personne pour s’assurer qu’un médicament fonctionne efficacement et réduire le risque d’événements indésirables graves. Cependant, les scientifiques devront effectuer beaucoup plus de recherches pour se faire une idée plus claire du fonctionnement de ces interactions.

Pour l'instant, notre compréhension de l'influence des bactéries intestinales et du métabolisme des médicaments en est encore à ses balbutiements. Néanmoins, les résultats de cette dernière étude donnent à penser que nos bactéries intestinales ont au moins une certaine influence sur les médicaments que nous prenons.

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