Les probiotiques pourraient-ils évoluer dans l'intestin et causer des dommages?

Nouvelle recherche dans la revue Hôte cellulaire et microbiome suggère que dans certaines conditions, les probiotiques peuvent être nocifs en raison de leur capacité à évoluer une fois dans l'intestin.

Pour certaines personnes, les probiotiques peuvent faire plus de mal que de bien.

Les probiotiques sont des micro-organismes vivants qui jouent un rôle clé dans la fonction intestinale.

Ils y parviennent en aidant à créer un équilibre bactérien sain dans l'intestin de l'hôte.

Notre corps contient déjà environ 1,5 kilogramme de bactéries probiotiques.

Cependant, ces micro-organismes se produisent également dans les aliments fermentés tels que le yogourt, le kimchi, le miso et certains types de fromage.

Récemment, beaucoup de battage médiatique a entouré les bienfaits présumés des probiotiques pour la santé. Certains de ces avantages comprennent une aide à la digestion, une baisse de la tension artérielle, une amélioration de la fonction cognitive et un soulagement du syndrome du côlon irritable.

Cependant, les probiotiques sont-ils un bien absolu? Alors que de plus en plus de gens commencent à les consommer, des recherches émergentes préviennent que les probiotiques peuvent ne pas fonctionner de la même manière pour tout le monde et que certaines souches de probiotiques peuvent même ne pas être sûres.

Maintenant, une nouvelle étude offre un regard critique sur les bienfaits thérapeutiques des probiotiques. Des scientifiques de l'École de médecine de l'Université de Washington à St. Louis, MO, ont étudié le comportement d'une souche de Escherichia coli dans les intestins des souris.

Gautam Dantas, Ph.D. - un professeur de pathologie et d'immunologie, de microbiologie moléculaire et de génie biomédical à l'université - a dirigé la nouvelle recherche.

Comment les probiotiques changent dans l'intestin

Le professeur Dantas et ses collègues ont choisi le probiotique E. coli Nissle 1917 parce que les chercheurs pensent qu'il a des propriétés anti-diarrhéiques.

Ils voulaient voir comment la bactérie se comportait dans le tube digestif des souris, ils ont donc utilisé des rongeurs qui avaient quatre types différents de microbiome intestinal:

  • un microbiome sans bactérie préexistante
  • un microbiome avec une gamme limitée et déséquilibrée de bactéries, ce qui correspond souvent à un microbiome malsain
  • un microbiome intestinal normal
  • un microbiome intestinal normal traité avec des antibiotiques

Le professeur Dantas et ses collègues ont nourri les souris avec des probiotiques et différents régimes. Ils ont conçu un régime pour imiter un régime normal riche en fibres, un autre pour imiter un régime occidental riche en graisses et en sucres et faible en fibres, et un autre pour imiter le régime occidental mais avec plus de fibres.

Après 5 semaines, les chercheurs ont analysé les microbiomes des rongeurs. Ils ont découvert que la bactérie avait changé pour développer de nouvelles caractéristiques.

Dans certaines conditions, la bactérie a nui à l'hôte, mangeant la couche protectrice qui tapisse l'intestin. Des recherches antérieures ont établi un lien entre les dommages de cette couche protectrice et le syndrome du côlon irritable.

«Dans un contexte sain et riche en diversité, nous n’avons pas capturé beaucoup d’adaptation, peut-être parce que c’est le contexte auquel Nissle est habitué», rapporte la première auteure de l’étude, Aura Ferreiro.

«Mais vous devez vous rappeler que, bien souvent, nous n’utiliserions pas de probiotiques chez les personnes ayant un microbiome sain. Nous les utiliserions chez les personnes malades qui ont un microbiome peu diversifié et insalubre. Et cela semble être la condition dans laquelle le probiotique est le plus susceptible d'évoluer.

«Utiliser les êtres vivants comme médicaments» nécessite des soins

Les experts développent actuellement des probiotiques dans des traitements pour des conditions telles que la maladie inflammatoire de l'intestin, la phénylcétonurie (PKU) et l'entérocolite nécrosante.

Cependant, les résultats de la nouvelle étude suggèrent qu'un probiotique bénéfique pour une personne pourrait s'adapter et devenir nocif pour une autre.

«Si nous voulons utiliser des êtres vivants comme médicaments, nous devons reconnaître qu’ils vont s’adapter, ce qui signifie que ce que vous mettez dans votre corps n’est pas nécessairement ce qui sera là, même quelques heures plus tard.»

Professeur Gautam Dantas

«Il n'y a pas de microbe à l'abri de l'évolution», poursuit le professeur Dantas. «Ce n’est pas une raison pour ne pas développer des thérapies à base de probiotiques, mais c’est une raison pour nous assurer que nous comprenons comment elles changent et dans quelles conditions.»

Pour acquérir une telle compréhension, les chercheurs ont créé un traitement probiotique pour la PKU, une maladie métabolique pouvant causer des lésions cérébrales.

Dans la PKU, le corps ne peut pas dégrader une substance appelée phénylalanine. Des niveaux excessifs de cette substance provoquent éventuellement des dommages neurologiques. Cependant, le professeur Dantas et son équipe ont modifié génétiquement le Nissle E. coli souche d'une manière qui lui a permis de décomposer la phénylalanine et de l'excréter dans l'urine.

À l'aide d'un modèle murin de PKU, les chercheurs ont administré le E. coli souche les rongeurs. Le traitement a réduit de moitié les niveaux de phénylalanine le lendemain.

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